L'établissement Kawarami a la particularité d'apprendre à ses étudiants des techniques de combat qu'ils peuvent mettre en application pour régler leurs conflits en se provoquant en duel. Yamato Naoe est un élève de la classe 2-F qui n'a aucune compétence dans l'art du combat mais dont l'intelligence se révèle d'une incroyable efficacité. Tacticien de la famille Kazama, il commande des étudiants-guerriers qui sont aussi ses amis les plus fidèles, comme Momoyo Kawakami, une des meilleures combattantes au monde, qu'il considère comme sa sœur. Mais les batailles interclasses vont rapidement se dissiper et laisser place à de sombres affaires d'État top secret dans lesquelles ils se trouveront impliqués malgré eux…