Komi-san est la plus jolie fille du lycée et les personnes autour d'elle ne peuvent s'empêcher de la regarder. Presque toute l'école la voit comme une beauté froide qui n'est pas à leur portée, mais Tadano Hitohito connaît la vérité : elle est tout simplement trop timide pour communiquer avec les autres. Komi-san, qui souhaite corriger cette mauvaise habitude, va essayer de changer avec l'aide de Tadano.